Entidades dependientes
Mondragon Unibertsitatea es una universidad joven, creada en 1997 y reconocida oficialmente por la ley 4/1997 del 30 de mayo y en la actualidad no cuenta con ninguna fundación ni entidad dependiente.
La Universidad nace por la asociación de tres cooperativas, avaladas por una extensa trayectoria y experiencia en el mundo de la enseñanza, Mondragon Goi Eskola Politeknikoa "Jose Mª Arizmendiarrieta, S. Coop., ETEO S. Coop. (en la actualidad MU Enpresagintza S. Coop.) e Irakasle Eskola S. Coop., lo que a su vez constituyen hoy en día las dos Facultades y Escuela de Ingeniería de la Universidad.
Mondragon Unibertsitatea es una cooperativa de segundo grado consitutida por dichas facultades que a su vez, como cooperaitvas de primer grado, constityen entidades jurídicas independientes y participan en la cooperativa de segundo grado según los términos establecidos en lso estatutos de la misma.
La Facultad de Ciencias Gastronómicas, centro adscrito a Mondragon Unibertsitatea, es parte de la Fundación Basque Culinary Center Hezkuntza Fundazioa, de cuyo patronato es parte mondragon Unibertsitatea y cuyo cargo de Presidente y Secretaria recaen en el Rector y Secretaria General de la Universidad.